He hecho la lista sacada de transfermarkt.de, la página MÁS FIABLE actualmente de fichajes, el que no la conozca, no sabe de fútbol:
Barcelona 2008-2012
2008/2009: 96 millones (Keita 14, Piqué 5, Cáceres 16.5, Alves 33.5, Henrique 8, Hleb 17)
2009/2010: 113 millones (Maxwell 4.5, Keirrison 14, Zlatan 69.5, Chygro 25)
2010/2011: 72,5 millones (Afellay 3, Adriano 9.5, Villa 40, Mascherano 20)
2011/2012: 60 millones (Alexis 26, Cesc 34)
Total: 341,5 millones
Real Madrid 2008-2012
2008/2009: 82.2 millones (Huntelaar 27, Lass 20, Faubert 1.5, De La Red 4.7, Javi García 4, Garay 10, Van der Vaart 15)
2009/2010: 257 millones (Arbeloa 4, Granero 4, Albiol 15, Benzema 35, CR 94, Negredo 5, Kakà 65, Xabi 35)
2010/2011: 93 millones (Adebayor 4, Canales 6, Khedira 14, P.León 10, Di María 33, Carvalho 8, Ozil 18)
2011/2012: 55 millones (Coentrao 30, Varane 10, Callejón 5, Sahin 10)
Total: 487.2 millones
Aún así yo quitaría lo de Adebayor, sí.
También habría que mirar los contratos de jugadores de ambos clubs que tenían cláusulas de pagar más si ganaban títulos (si no recuerdo mal, al final Alves ha debido costar una panojada guapa).