Yo lo que te recomiendo es lo siguiente:
Saca el HD y mete el SSD en la ranura.
Instala en el SSD sin tener el HD metido.
Una vez tengas todo instalado, mete el HD. Debería arrancar desde el SO del SSD pero si no, seleccionas la unidad de arranque como el SSD y vía.
Particiona y/o formatea el HD como veas y a correr.
Lo de instalar sin el HD te lo recomiendo porque yo en el sobremesa recientemente he tenido problemas, ya que Windows 8 me escribía en le MBR de un disco duro que tenía, y al ir haciendo instalaciones, pese a que formateaba el raid de ssd, por cada instalación que hacía en los ssd me creaba una entrada en la mbr del otro disco duro y acabé con un arranque de 7 sistemas operativos(de los cuales solo uno funcionaba) y un cacao de la leche.
El ssd, si vas a poner Windows 8, actualiza el firmware antes, yo con unos M4 tuve un problema de la leche y solo se solucionó actualizando el firmware.