Los míos por franquicia para "simplificar" un poco:
-Super Mario Bros, Super Mario Bros 3, Super Mario World y Super Mario 64.
-Yoshi´s Island de supernes y Yoshi´s Story de N64.
-El primer Castlevania, Castlevania III, Super Castlevania IV, Castlevania 64 y Castlevania Legacy of Darkness.
-Super Mario Kart y Mario Kart 64
-F-zero y F-zero X
-Star Fox y Star Fox 64
-TLoZ A Link To The Past y TLoZ Ocarina of time(curiosamente el Majora´s Mask no lo rejuego mucho).
-El primer Contra de nes y Contra III "The Alien Wars".
-Super Ghouls & Ghost y Demon´s Crest(en teoría no es la misma franquicia pero es el mismo universo).
-Trilogía Donkey Kong Country y Donkey Kong 64
-Killer Instinct supernes y Killer Instinct Gold de N64
-Street Fighter 2, Street Fighter 2 Turbo y Super Street Fighter 2
-Mortal Kombat 1 y 2(el 3 no lo juego mucho, después abandone la franquicia)
-Battetoads de nes y Battletoads in Battlemaniac de supernes.
-TMNT Turtles in Time
-Mega Man del 1 al 6 de nes y Mega Man X 1-2-3 de Supernes.
-Prince of Persia versión Supernes.
-Joe & Mac 1 y 2 de Supernes
-Trilogía Cruis´n de N64
-Legend(este juego me encanta).
-Trilogia Super Star Wars de supernes y Star Wars Shadows Of The Empire de N64.
-Tiny Toons Buster Busts Loose.
-Batman Returns de supernes.
Y me faltan mas pero he puesto los mas importantes, creo.