yo no uso mames de línea de comandos salvo necesidad (mi consola portátil 486 =0), pero en los instalables -véase con interfaz apañá- (mameplus o, preferentemente, kaillera (que pasó con él?)) tienes la opción enable joystick input, enable mouse..... incluso lightgun! requiere reiniciar mame para pillarlo
Si windows te reconoce el pad el mame tambien debería
Una vez dentro de cualquier juego le das a tabulador y configuras teclas
Puedes poner cuatro pads sin problema
saludos!