Yo no lo noto, apenas nada, y tengo M.2 tanto en el sobremesa como en el portátil. En un equipo doméstico, aunque tengas 3 navegadores abiertos con 20 pestañas cada uno, estés instalando un juego, y copiando la discografía de maluma desde un pendrive es raro pasar de 20K-30K IOPS.
De hecho los valores de IOPS que publicitan los fabricantes se suelen alcanzar con longitudes de cola altas (QD32/QD64), eso es imposible de ver con aplicaciones en el PC de casa, un escenario tan favorable se da en un disco que se usa de búfer para algo muy pesado (BBDD o similar) y poco más.
Evidentemente, si te lo puedes permitir, mejor. Solo por el espacio que ahorras es una ventaja, y más rendimiento no hace mal a nadie. Eso sí, personalmente diría que rara vez vale la pena. Se multiplica el precio por giga, se multiplican las velocidades en secuencial (y IOPS en condiciones ideales), pero es complicado notarlo en absoluto. Ni comparación con el salto mecánico->ssd, incluso ssd SATA cutre->SSD bueno.
Saludos