No se si te haz ebnterado PERO el emulador necesita ciertos requisitos..Entre ellos que las roms DEBEN estar en la carpeta llamada "Snes" en la raiz de la memoria (si tu carpeta no esta ahi o tiene otro nombre simplemente NO FUNCIONARA) Este emulador en particular NO POSEE navegacion entre directorios como lo tiene el emu de MD o de NES por mencionar algunos asi que hay que respetar esa indicacion que en particular te he dado...
Por otra parte (supone claro) que la R4 autoparcha DLDI asi que por mas que lo parches para esta u otra unidad esta hara lo que le de la gana..
Asi que Tengo el 90% de seguridad que tus roms estan mal ubicadas..