MSI, AsRock, Gigabyte... Son solo marcas o ensambladores.
Es como si te digo una camiseta Nike o Adidas. Sigue siendo una camiseta, solo varia la marca y las prestaciones que le incluya cada marca.
Y por supuesto no tienen porque coincidir la marca de la placa con la de la gráfica. Hay marcas que son famosas por sus placas y no tanto por sus gráficas y viceversa.
Resumiendo, que puedes tener una placa gigabyte y una gráfica EVGA, por ejemplo.