Posiblemente sea un problema derivado de este.
Yo, según he leído, tienes un problema de ruido y temperatura.
Primero, como te han comentado, revisa que este bien puesto el disipador del procesador, con la pasta justa y bien puesto, sin estar doblado ni torcido, si es el de origen, te recomiendo, como han hecho otros compañeros, que cambies de disipador por uno mas decente, no digo que el de serie sea malo, pero mejor cualquier otro.
La fuente, que suele ser otro de los causantes del ruido, posiblemente sea una genérica que al necesitar carga se caliente en exceso y haga mucho ruido, en la fuente no escatimaría y pillaría algo de calidad, PFC activo, 8o plus bronce como mínimo, etc...
A parte, no comentas nada de la caja, si esta bien ventilada y con un circuito bien equilibrado de ventiladores, la acumulación de calor dentro de la caja puede ser otra de las causas del ruido.
Todo suma, por lo que deberías detallar bien todo lo que tienes para poder sacar alguna conclusión mas clara.
Una cosa mas, todos esos errores de las aplicaciones pueden ser debido a que al apagarse tan a menudo el equipo se haya petado el disco duro, algún sector, o incluso que el disco duro le haya dado un buen calenton, ya que las temperaturas altas no son tampoco muy buenas para los discos duros.