Al final la cosa se ha "arreglado" sola. Al poco de escribir el mensaje, me dio un pantallazo azul y se fue todo al carajo. Al reiniciar, el espacio perdido apareció por arte de magia. Y, de paso, algún programa ha dejado de funcionar correctamente.
Tendré que pasarle unos tests de integridad al disco duro, antimalwares varios y, en caso de duda, formateo y reinstalación de todo.
Gracias a todos.