Hola, si el disco se deja bloquear ya no tienes problema alguno, para bloquearlo te recomiendo que lo hagas con el ConfigMagic pues no se si sabras que le mete un masterpassword genérico
XBOXSCENE el cual en un momento dado viene muy bien para desbloquear el disco duro sin tener el eeprom.bin
Para el problema de la capacidad puedes probar a lanzar una bios desde el EOL, en concreto la F grande forzado y mira la capacidad que te da el UnleashX, si todo es correcto te vas al Xboxpartitioner y reformateas esta partición con el cluster a 32K, reinicia y mira si se queda esa capacidad.
Si te sigue dando problemas la bios puedes usar el flasbios del Eol con la bios de 1 mega 3.3.3 para v1.6 y repetir el paso del Xbpartitioner