Por fuera las diferencias son que el NTFS permite gestionar
permisos al estilo de Unix. Y creo que tambien admite compresión de carpetas.
Ademas rompe las limitaciones en los tamaños de los archivos.
(en fat no pueden superar los 4GB ¿o eran 2?)
Internamente no se que decirte por que no se como va exactamente el
NTFS por dentro.