Nada de que preocuparse. Como te dicen, son las uniones de los polígonos.
Cuando se diseña algo en 3D, hay que situarlo sobre la superficie dentro de un "entorno" (cubo, esfera...). Es normal que a veces los objetos no casen con la superficie donde se situan.
Los "fallos" así son de lo más común, especialmente si el juego tiene un mapeado enorme (y el Assassin's Creed lo tiene). Cuando hay tanta gente trabajando, hay alguno que dice "esto lo habrá hecho el otro" y "el uno por el otro, la casa sin barrer".
Peor aún es en juegos donde tienes panorámica de cámaras desde abajo de los objetos que veas a través de las texturas.