No, el anime de Haruhi, es desorden lo pusieron a propósito. En las novelas si hay un cierto desorden, pero no es el que se muestra en la serie. Por ejemplo, la primera y la segunda novelas son seguidas y sin mierdas. Luego la 3º y la 5º son recompilacion de historias cortas que había escrito para revistas. Están "desordenadas" pero es que desde un inicio no son novelas.
El problema en el primer anime es que quisieron poner la primera novela y trozos de la 3 y la 5, a parte de la segunda en forma de capitulo 0. Claro, hay partes bastante aburridas, y desordenadon de manera que en el ultimo capitulo hubiera el climax de la serie, que es el climax de la primera novela.
La segunda temporada ya es un desproposito. No solo el verano infinito es la peor puta mierda del mundo, sino que el director de la primera temporada abandono el proyecto cuando supo que querían hacer tal mierda y la serie cogió una mala animación de la ostia sumado a un K-ONnizacion bastante mala. Vamos, que porque la novelas están bien, pero es una puta mierda a nivel animación.