Yo la tenia en la mesa hasta que compre la 7950 que la tuve que bajar al suelo porque el coil whine me molestaba (ruidito electrico de la propia grafica vamos)
El resultado es que el PC se ensucia muchísimo mas, se lleva mas golpes que en la mesa, etc, etc. A nivel de refrigeracion yo veo mejor sobre la mesa, por mas que no pille tanto aire frio, en el suelo ya puede pillar el aire frio que quieras que en varias semanas lo tienes lleno de polvo y al final se te va a calentar mas.