En la MDK 10 me he encotrado una utilidad que se pone
en la barra de herramientas del KDE y permite cambiar
el refresco y la resolución sin reiniciar las X.
Aunque me temo que tambien saca los posibles valores
del XF86config
Edito:
Acabo de acrodarme de que si puedes escribir en el Home
las X buscan primero la configuración hay ~/XF86Config
(al menos cuando se arrancan "a mano" con startx)