Si tienes desactivada la memoria virtual, puede que ese sea el problema, comprueba que la ram no se te llene, y el ruido puede ser la cpu trabajando , tambien puede ser que el disco este puesto en modo de ahorro de energía, y al utilizarlo arranca, y tarda unos segundos en reaccionar(de ahi tambien el ruido, aunque los ssd, yo creo que no hacen ruido).