Bueno, yo pregunto desde la ignorancia; pero si es un circuito cerrado, y por debajo del deposito, no deberia afectar para nada. La unica diferencia destacable es que si los bloques de las graficas estan arriba lo logico seria empalmar directamente alli el liquido ya enfriado, en vez de al procesador.
De todas maneras si es solo por estetica siempre puedes optar por un modelo sin ventana que una caja con luz, en muchos casos, estorba mas que ayuda...