Para DS hay varios, "stuck pixel fixer" es otro de ellos, pero yo no me fiaría mucho. Como la resolución de la 3DS es mayor, los programas de DS se muestran reescalados, y además en la pantalla superior quedan dos franjas verticales en negro a los lados. Los píxeles atascados de un color fijo se verán sobre el negro, pero los píxeles muertos no.
Puede que si lo ejecutas con Select pulsado no te haga el reescalado, pero entonces deja más espacio en negro aún alrededor de la imagen.
¿Alguien conoce algún homebrew de este estilo pero nativo para 3DS?