Yo sólo tengo pendrives de 8GB y discos duros USB mucho mayores. Pero lo que es flash,... no.
Te voy a sugerir algo: Haz una partición que ocupe todo el pendrive y luego formateas la partición.
Explicación del disparate: La única diferencia que tengo entre mis pendrives y mis discos duros es que mis pendrives están sin particionar (todo ello es una gran partición sin tabla de particiones) y mis discos duros usb si tienen tabla de particiones. (Y,... total, por probar no pierdes nada xD).