Si no tengo mal entendido, y ahora que me he puesto en el tema con los míos y mi caja nueva, los laterales (o lateral en mi caso) sirven para meter aire que da de forma directa a la cpu y gráfica, aprovechando ademas el hecho de encontrarse con el flujo de corriente que crea el ventilador frontal (metiendo aire nuevo) con el trasero, el cual lo saca de la torre.
Saludos!