Hola.
Pues tras un par de días mi experiencia con la forma de apagar es la siguiente:
A mi me gusta apagarla del todo, y he visto como hacerlo; si dejo la switch puesta en el dock (modo TV), presiono el botón Power de la consola hasta que sale el menú de apagado y en opciones de apagado te dice reiniciar o apagar, allí lo selecciono con el mando perro (los dos JoiCon unidos en el Grip) y elijo apagar, asi la consola se apaga del todo (creo estar en lo correcto, que alguien me corrija si no es asi..), luego como lo tengo en una regleta, apago la regleta desde el interruptor de la misma y ya esta.
Para encenderla, doy de nuevo al interruptor de la regleta para alimentar el Dock, la consola aun no se enciende, pero a mi me funciona encenderla desde el mando.., mantengo pulsado el botón de HOME (en el mando) y se me enciende la consola, sin necesidad como dicen de tener que pulsar el botón Power de la propia consola..
Saludos.