Yo luego de un rato por fin de con la solución del RA. Luego de cambiar el init y tenera carpeta de roms con muy pocos juegos, he desmarcado los 30 juegos originales y ya no saltaba el error C6 en RetroArch. Mi cuenta que como tenía pocos, no me creaba la dichosa carpeta y me di cuenta del problema. Volví a activar todos los 30 juegos (en total 51) pero he subido el límite de juegos por carpeta a 90. Ya sin carpetas, el RA funcionó.