Yo de momento no tengo problemas en la versión 2.14b, eso sí, no uso los cores aparte, es decir, uso el retroarch.hmod que vino desde el principio de la 2.12, donde estaban todos los cores ahí dentro.
De la versión 2.13e he pasado las carpetas: Config, dump, Games y user_mods a la versión 2.14b, he añadido el Prehistoric Isle 2 que ocupa 54MB y todo perfecto, que por cierto, si alguien quiere ese juego, se emula con el FBA normal, he intentado con el mame2003 y nada, pero con el FBA funca.