Como yo lo veo, si fuera por cuestión de que Nintendo detecta los IDs de los juegos/apps/DLCs/homebrews instalados (desde .cias), también tendrían que eliminarse los que sean de otras regiones o los que vengan con "region free" (igual si ellos quisieran simplemente podrían contrastar las IDs de las cosas instaladas con las IDs de las adquiridas desde eShop o que vienen de fábrica, es decir detectar los cias legitimamente adquiridos).
La verdad todo esto suena más a paranoia que a otra cosa, pero tampoco estoy en contra del método y, de hecho, me parece bien por las personas que han optado por usar todo lo posible desde el HBL con Rosalina. Saludos