... enseguida sabrás si pierde calidad o no, dale al play y si la vez bien pues bien está.
Ya se que la respuesta suena peregrina, pero al final es tan sencillo como eso. Si ha perdido calidad pero tu no la notas, que más dará. Si quieres algo más técnico:
Si usas la opción tsmuxer mira a ver cual es el bitrate máximo para transcodificar al vuelo, es mayor el del video que esta cifra? Si es así si pierdes calidad.
Es inferior? probablemente la pérdida no la notes (al menos no tanto).
Yo, como he dicho antes, recomiendo pasarlas por el mkv2vob. En el 90% de los casos no transcodifica, solo cambia el contenedor multimedia (de mkv a TS), con lo que el stream de video es EXACTAMENTE el mismo, sin pérdida. Por cierto, aunque haya más opciones de contenedor en el mkv2vob son "falsas" siempre hace un ts y luegola renombra a vob,m2ts ... etc. Incluso el programa te avisa de esto.