Super Monkey Ball Banana Rumble ofrece un modo aventura protagonizado por AiAi y sus amigos, que durante sus vacaciones en la isla tropical conocen a Palette, una aventurera que está buscando el Plátano Legendario. AiAi y compañía se unen a ella en un viaje que les llevará por diferentes escenarios donde tendrán que encontrar las piezas especiales que son la clave para localizar la mencionada reliquia. Este modo ofrece una historia contada a través de cinemáticas y presenta 200 fases nuevas repartidas por cinco mundos, cada uno con su propia mecánica, que se pueden completar en solitario o un equipo de hasta cuatro jugadores.
Otra opción que propone Super Monkey Ball Banana Rumble es el modo multijugador Batalla donde se pueden formar grupos de hasta 16 jugadores. En caso de no tener tantos amigos existe la opción de añadir un máximo de 15 bots. Los modos multijugador disponibles son:
- Carrera: competición para llegar a la meta antes que nadie.
- Cazaplátanos: recoge tantos plátanos como sea posible antes de que se agote el tiempo.
- ¡Pláta-PUM!: los jugadores se pasan una bomba y quien termine la ronda sin una gana puntos.
- Fiebre por la meta: un modo por equipos donde hay que atravesar las metas para ganar puntos.
- Combate robótico: dos equipos compiten mientras golpean a unos robots gigantes.
