Bueno, para los que tengan problemas con FaceTime y My3G en ios4.1 :
A mi no me funcionaba, pero parece que hay forma de solucionarlo:
En My3G activas la flag para FaceTime.
En SBSettints he ido a MobileSustrate, y he desactivado My3G, hecho respring y vuelto a activar después del respring. Hacer respring una vez mas.
El toogle de My3G de SBSettings lo he puesto en Always ON: Y ahí ya me ha funcionado FaceTime via 3G (hay que tener el WiFi encendido, no hace falta estar conectado a ninguna red, pero si que es imprescindible que esté encendido)
Luego he vuelto a poner el toogle para que My3G solo funcione con las aplicaciones de su lista, y ha funcionado a la perfección de nuevo.
Bueno, en realidad no he llegado a realizar la llamada, pero al menos dejaba hacerla, cosa que cuando no funcionaba, salía un mensaje diciendo que había que estar conectado a una red WiFI para usar FT.
Espero que sirva de ayuda a alguien que esté como yo