para una copia de todo lo de Cydia: PkgBackup (una vez hecho, sincronizas el iPhone con iTunes y te guarda toda la información en un contacto de agenda. una vez hecho jailbreak de nuevo, sincronizar la agenda o el contacto creado, volver a bajar PkgBackup, esta vez pulsar restore y ya nos pondrá todo lo que teníamos). la nueva versión deja guardar también en DropBox
para una copia de los datos de las App: DataDeposit (requiere una cuenta en DropBox, ya que todos los datos nos los subirá allí. una vez realizado el jailbreak de nuevo, descargar DataDeposit, le damos a restore, y nos descargará los datos de las app que habíamos seleccionado)
también está AptBackup, para lo de Cydia