para todos los que tengan dudas,
los dos se pueden reprogramar, pero si te quedas mas tranquilo teniendo el atmel,(lo digo por que hay mas info de como reprogramarlo y quizas sea mas facil) lo que tienes que hacer es lo siguiente.
Instalas el flip de Atmel (ahora mismo creo que estan en la V 3.4.2)
Con esto ya tienes los drivers instalados.
Conectas el PS3Break al usb y pulsas upgrade.
Ahora windows te lo reconoce.
Te saldra el asistente de instalacion, le das as instalar manualmente, luego en la siguiente ventana donde dice buscar el controlador mas adecuado en estas ubicaciones.
desmarcas en medios extraibles cdrom etc, y marcas la siguiente donde pone, incluir esta ubicacion en la busqueda.
le das a examinar y buscas c/archivos de programa/atmel/flip3.4.2/usb y listo
pulsas siguiente y esperas a que instale.
Felicidades, ya tienes tu at90usb162 listo para programar.
el resto es cosa vuestra.
P.D. esta claro que si no te lo reconoce es que no tienes el Atmel