Les cuento mi experiencia:
Seguí el tutorial al pie de la letra, luego de tener la emunand ya inyectada y funcionando ví que no era estable y se bloqueaba, por lo que dentro de la emunand realicé el formato de 3DS (Configuración de Consola, Otras opciones, Fomarteo).
Luego de configurar los ajustes básicos de Nintendo 3DS, la Emunand quedó totalmente limpia y sin bloqueos, por lo cual empecé con el Run.bat obteniendo como resultado el error de conexión ya conocido "Failed to Connect". Asigné una dirección IP estatica en la 3DS dentro del mismo rango que el PC y permanecía en el mismo error, por lo que realicé un ping desde el PC a la 3DS evidenciando que no contestaba al primer intento, pero luego del segundo ping ya contestaba, al correr nuevamente el Run.bat Eureka! funcionó... Pero la alegría no es infinita, ahora obteniendo el famoso problema de command-index:1, he probado el DevMenu_2x.cia de Govanify, el BigBlueMenu.cia renombrado pero nada sigo con el mismo error.
Resumiendo para los que tienen error de Failed to Connect:1. Formatear Emunand desde 3DS.
2. Asignar dirección IP Estática en la emunand de 3DS dentro del mismo rango de direcciones que el PC.
3. Hacer Ping desde el PC a la IP de 3DS y esperar a que responda.
4. Ejecutar el Run.bat y verificar que se ejecute.
5. Cruzar los dedos para que no quedes en command-index:1 como yo
Un saludo