En principio es necesario activar el modo instinto para cancelar el combo, si no estás en mitad de un combo casi seguro que no cuenta. Por ejemplo Iniciador -> Auto -> Enlace y cancelo con el modo instinto para continuar golpeando después. Me ha saltado jugando en partidas igualadas, y haciéndolo varias veces seguidas (una o dos veces por cada partida, tras rellenar la barra).
En cuanto al porcentaje del reto tampoco te puedes fiar, hay algunos logros (por ejemplo el de ganar 20 partidas igualadas con cada personaje) en los que no registra paso a paso el progreso, por lo que no tienes controlado cuándo va a saltar.