Lo de PoGoBag no significa que no sea seguro. Simplemente dejan claro que utilizarlo estaria fuera de los terminos de servicio de Niantic, al igual que pasaba con PokéVision.
Ahora mismo Niantic no esta tomando medidas para este tipo de sitios, ya que no alteran la jugabilidad, como puede ser con el uso de bots, o sobrecargando los servidores, como puede ser con el uso de mapas radar.
Aun asi, no se sabe si en un futuro Niantic tomara medidas, pero de tomarlas, supongo que seria cerrando las paginas y no perjudicando a los usuarios, ya que no estan sacando ninguna ventaja frente a otros jugadores, ni estan haciendo nada que modifique o altere la jugabilidad.