Super Mario Maker estará disponible para 3DS y será un juego con todas las herramientas de creación de niveles y opciones que ofrece la versión de Wii U. Será posible jugar en la portátil a (no todos) los niveles creados en la consola de sobremesa, aunque no podrán ser encontradas mediante la ID.
Nintendo quiere que los jugadores de Super Mario Maker para 3DS creen comunidades más pequeñas que en Wii U, y con este objetivo permitirá cooperar para crear niveles y compartirlos a través de Street Pass. En su lanzamiento el juego incluirá 100 niveles concebidos por los desarrolladores.
Poochy & Yoshi's Woolly World es la versión para 3DS de Yoshi's Woolly World para Wii U. Se trata de la misma aventura de Yoshi en un mundo de tela, pero con la introducción de nuevos niveles diseñados específicamente para Poochy, el amigo de Yoshi. También introduce los Poochitos que indicarán la presencia de secretos y objetos coleccionables.
Poochy & Yoshi's Woolly World llegará el 3 de febrero de 2017, el mismo día que estará disponible el amiibo de Poochy.
El nuevo Pikmin para 3DS es una aventura de desplazamiento lateral. Los pikmin seguirán a Olimar y tocando la pantalla táctil se señalará dónde deben actuar. Podrán mover objetos, luchar contra criaturas o transportar tesoros hasta un objetivo. Como manda la tradición los pikmin rojos serán resistentes al fuego, los azules se sentirán perfectamente bien en el agua y los amarillos son inmunes a la electricidad.
El juego, que aún no tiene nombre oficial, estará disponible durante el 2017.
Otro nuevo título para 3DS anunciado durante el Direct ha sido Mario Sports Superstars. Se trata de una compilación que incluye cinco deportes: Fútbol, béisbol, tenis, golf y equitación. Todos los deportes podrán ser jugados en el modo para un jugador y en el modo multijugador en línea o local.
Mario Sports Superstars estará disponible durante el 2017.
The Pokémon Company International y Nintendo han desvelado que aquellos que compren Pokémon Sol o Pokémon Luna hasta el miércoles 11 de enero de 2017 recibirán como obsequio un Munchlax con Snorlastal Z. Cuando Munchlax evoluciona a Snorlax y lleva equipado su Snorlastal Z, es capaz de ejecutar un movimiento Z especial que ningún otro Pokémon puede usar: Arrojo Intempestivo.
Además, también se ha presentado el pokémon Rattata de Alola, que a diferencia del Rattata habitual vive principalmente en zonas urbanas. Esta criatura es un ser nocturno que vive en nidos de varias docenas liderados por algún Raticate de Alola.
Durante el Nintendo Direct la compañía también ha anunciado que Dragon Quest VII: Fragmentos de un Mundo Olvidadoestará disponible el 16 de septiembre de 2016 y mostrado nuevos vídeos de Mario Party: Star Rush (disponible el 7 de octubre) y Ever Oasis (disponible durante el 2017), el rpg de acción anunciado durante el E3 2016.
