No creo que una ISO scrubbeada funcione sin haber pasado por el Backup Creator.
Principalmente porque, si eso fuera cierto, ¿Para qué se iba a molestar Waninkoko en programar una aplicación aparte habiendo otra que dá el mismo resultado?
Ignoro lo que hace ese programa sobre la ISO (una pena no tener el source), pero está claro, que tiene que eliminar algo, porque, por ejemplo, al pasar la ISO del DBZ Budokai Tenkaichi 3, el partition.iso acabó pesando menos que la ISO original, no recuerdo si era mucha diferencia o poca, pero algo perdió en el proceso.
Pienso, que si el Backup Creator, simplemente trimmeara la ISO, no haría falta el Wii Scrubber, puesto que, hasta donde yo sé, es eso lo que el hace.
Salu2