Hasta donde recuerdo el IPS no soporta el parcheo a roms de mas de 8MB (no recuerdo bien pero no pasa de 32MB) de hecho en las opciones de "abrir archivo" puedes ponerle "todos los archivos" y con eso podremos parchar NDS..Hice hace tiempo una version modificada del LIPS (para los parches de Pkmn) si la encuentro se las paso...