La voluntad de madara es tipo bu por lo que se ve, que a poco que quede, puede seguir viva y poseer un cuerpo, en este caso Obito y hacer uso de sus poderes. Vendría siendo como un parásito. (me ha recordado a Venom)
Por otro lado, ¿los ojos los tiene inutilizados esperando a que se arreglen porque se los han quemado, o por qué? :S No me ha quedado muy claro. Ahora lo que veo es a Madara tocho, recogiendo poderes y piezas de recambio.